В 2050 году злой ученый собирается выпустить на волю армию роботизированных динозавров. Теперь Конгу с друзьями предстоит дать им отпор и спасти ситуацию.

Упав в жерло вулкана, Конг и его друзья оказываются в подземном мире, кишащем настоящими динозаврами! Ботила задумывает устроить революцию на острове Конга.

Компания не пасует перед гейзерами, панической давкой и другими неприятными сюрпризами, пробираясь в храм, где их ждут новые зацепки относительно прошлого Конга.

На другом конце тоннеля команда находит гигантские создания, сеющие разрушения в Египте, а Ричард узнает, что находится в розыске.

Конг рад, что к нему снова относятся как к герою. Он греется в лучах славы на церемонии в Нью-Йорке. Но когда появляется Ботила, вечеринка превращается в противоборство.

Так как команде нужна новая главная база, они отправляются на остров Конга и выясняют, что его заполонили проказливые мартышки и другие бионоботы.

Вернувшись в храм, Дэнни и Зиппи исследуют тайный тоннель, пока остальные пробираются сквозь внезапный обвал. Ботила находит себе ровню в виде корабельного компьютера.

Лукас помогает спасти попавшего в беду детеныша динозавра, обезьяны показывают, на что способен ключ Дэнни, а Ботила применяет свои новые силы в космосе.

Когда Ботила угрожает взорвать Землю, Конг и его товарищи не жалеют сил, чтобы обезоружить спутник. Но Джонси в итоге застревает на другом корабле.

Клоны и бионоботы устраивают восстание, так как сыты по горло Ботилой. Преследуя Зиппи, Конг оказывается в плену у загадочной личности.

Вернувшись на остров Конга по сигналу Конга, Лукас и друзья сходятся в поединке с громадным врагом и получают помощь из неожиданного источника.